Σπουδές
Ο Ιωάννης Κανακάκης γεννήθηκε στο Ρέθυμνο Κρήτης, όπου ολοκλήρωσε τις γυμνασιακές σπουδές του. Εισήχθη, μετά από πανελλήνιες εξετάσεις, στην Ιατρική Σχολή του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης.
Μετά την εκπλήρωση της υπηρεσίας υπαίθρου έλαβε την ειδικότητα της Καρδιολογίας στη Θεραπευτική Κλινική του ΕΚΠΑ υπό τον Καθηγητη Σπυρίδωνα Μουλόπουλο. Παράλληλα εκπόνησε τη διδακτορική του διατριβή στη μηχανική υποβοήθηση της κυκλοφορίας και στην αλληλεπίδραση αριστεράς και δεξιάς κοιλίας, την οποία ολοκλήρωσε το 1994 με βαθμό άριστα.
Μετεκπαιδεύτηκε στο Πανεπιστημιακό Νοσοκομειο του Maastricht στην Ολλανδία στην επεμβατική καρδιολογία, όπου συμμετειχε σε ερευνητικό πρόγραμμα για την επαναιμάτωση στο ΟΕΜ, σε συνεργασία με την Καρδιολογική Κλινική του Eindhoven.
Επαγγελματική διαδρομή
Με την επιστροφή του υπηρέτησε διαδοχικά στη Θεραπευτική Κλινική ως Επιμελητης Β’, Επιμελητης Α’, Αναπληρωτης Διευθυντης και από το 2009 ως Διευθυντής του ΕΣΥ. Εργάσθηκε επί 15 έτη στην Καρδιολογική Μονάδα της Θεραπευτικής Κλινικής υπό τον Καθηγητη Ι. Νανά. Κατά την τετραετία 2009-2013 ήταν επιστημονικός υπεύθυνος της Καρδιολογικής Μονάδας του ΓΝΑ «Αλεξάνδρα». Το 2014 ανέλαβε τη διεύθυνση του Αιμοδυναμικού Τμήματος ΓΝΑ «Αλεξάνδρα». Συμμετειχε στην εκπόνηση διδακτορικών διατριβών και στο εκπαιδευτικό πρόγραμμα της Θεραπευτικής Κλινικής, στη διδασκαλία φοιτητων και των ειδικευομενων.
Από το 2009 μεχρι σήμερα είναι National Coordinator της Ευρωπαϊκής Πρωτοβουλίας Stent For Life, για την επεμβατική αντιμετώπιση των οξέων εμφραγμάτων του μυοκαρδίου. Κατά την περίοδο αυτή τετραπλασιάστηκε το ποσοστο ασθενών με STEMI που λαμβάνει θεραπεία επαναιμάτωσης με PPCI και δημιουργήθηκαν 3 δίκτυα PPCI στη χώρα.